Основните врагове на пингвините са:
Други животни
Леопардови фоки, орки, мехучки фоки и акули са някои от естествените хищници на пингвините. Тези животни ловят пингвини във водата, където пингвините са по-малко ловки и уязвими на атака.
Човешки дейности
Човешки дейности като прекомерен риболов, замърсяване и климатични промени могат също да навредят на пингвините и техните habitat. Прекомерният риболов намалява наличността на храна за пингвините, докато замърсяването и климатичните промени могат да унищожат техните размножителни зони и да смутят техните хранителни вериги.
Унищожение на habitat
Унищожаването на habitat на пингвините поради човешки дейности като урбанизация, минно дело и туризъм също може да има негативно въздействие върху популациите на пингвините.