Докато кафявите очи са най -често срещаният цвят на очите за немските овчари, те също могат да имат:
* Амбърни очи: Топъл, червеникаво-кафяв цвят.
* Сини очи: По -рядко, но възможно.
* Хетерохромия: Имайки две различни цветни очи. Това е рядко, но може да се появи в немските овчари.
Цветът на очите на немската овчарка се определя от количеството меланин, присъстващ в ириса. Колкото повече меланин, толкова по -тъмни очите.