Койотите, като другите псовидни (canids), имат хетеродонтна дентация (heterodont dentition), което означава, че имат различни видове зъби за различни функции:
Инцизиви (Incisors): Това са малките, остри зъби в предната част на устата, използвани за ухапване и чистене.
Кушчета (Canines): Това са дългите, остри зъби, разположени зад инцизивите. Те са най-силните зъби и се използват за дърпане и задържане на добыв.
Предмълзи (Premolars): Това са зъбите, разположени зад кушчетата, с остри върхове за рязане и измелчване на храна.
Мълзи (Molars): Това са плоските, широки зъби в задна част на устата, използвани за смачкване и измелчване на храна.
Койотите имат общо 42 зъба:
6 инцизиви на всяка страна на горната и долната челюст (12 общо)
2 кушчета на всяка страна на горната и долната челюст (4 общо)
8 предмълзи (4 на всяка страна, горна и долна)
6 мълзи (3 на всяка страна, горна и долна)
Тези специализирани зъби позволяват на койотите да ловят и ядат ефективно разнообразие от добыв, от малки глодачи до по-големи животни като елени.