Чистородните кучета идват от ограничен генен фон. Висока вероятност и два родители да носят мутирани/рецесивни гени, носещи здравейни проблеми.
Здравствени проблеми от анатомично изграждане
Преувеличени форми причиняват проблеми: Кавалер Кинг Чарлз спаfiel – главка твърде малка за мозъка. Брахицефални (мопс, пекинез, бостон терьер) – трудно дишане. Такси и дългогърби – гръбначни проблеми.
Генетични заболявания
Много се проявяват след приемане: епилепсия, прогресивна ретинална атрофия, дисплазия на тазовия ставища. Редки, но не смъртоносни: синдром на синия доберман (алинция при синьо/кафяви кучета). Разводчици опитват да елиминират чрез кастрация. Ортопедична фондация за животни сертифицира кучета без дисплазия.
Поведенчески проблеми
Разведени за специфична функция: пасене, битка. Булдогови породи – надзор при други кучета. Пасещи/ловечки – много движение, иначе деструктивни. Пасещи могат да "сбират" хора/деца натрапчиво.