1. Изгаряне при висока температура :Този метод включва изгаряне на заразените материали, включително труповете на засегнатите животни и всяко замърсено оборудване, при изключително високи температури. Високата топлина унищожава агента на BSE, предотвратявайки предаването му.
2. Химическа дезинфекция :Някои химикали, като натриев хидроксид (луга) и водороден пероксид, са ефективни при унищожаването на причинителя на СЕГ. Тези химикали се прилагат върху заразените материали, причинявайки денатуриране на протеини и инактивиране на инфекциозните приони.
3. Стерилизация с пара :Парата под високо налягане и температура също може да унищожи агента на BSE. Този метод често се използва за стерилизиране на медицински инструменти и оборудване и може да се прилага и за материали, заразени с СЕГ.