Побочни ефекти
Най-често докладваните странични ефекти на метotreксat са язве, недуг и абдоминален дискомфорт. Ниски бели krvни клетки могат да доведат до повишена восприимчивост към инфекции. Други странични ефекти са посочени по-долу по токсичност на органни системи. Тези токсичности и странични ефекти са произведени от инхибиране на основни биохимични пътища. Метotreксat е антиметаболит на фолат и инхибира ензим (дихидрофолат редуктаза), който метаболизира фолат съединения. Чрез инхибиране на този ензим, то намалява вида и количеството фолати, налични за биохимични реакции. Тези реакции включват синтеза на нуклеинови киселини (напр. ДНК и РНК), и клеточната обработка на белтъци. Депресиран нуклеинов синтез инхибира клеточното деление, което нарушава пролиферацията на различни ракови клетки. Тази активност не е изключително насочена към ракови клетки, и страничните ефекти на метotreксat причиняват нарушение на други фолат-свързани клеточни активности. Общата токсичност на метotreксat е функция на инхибиране на нормалната клеточна пролиферация в клетки и тъкани с висок обрат и нарушение на клеточни сигнали.
Хематологични
Костният мозък постоянно произвежда нови клетки. Тези клетки са есенциални за киселороден транспорт, имунна функция и заживяване на рани. Метotreксat може да инхибира клеточната производств в костния мозък и да причини депресия на нивата на червени krvни клетки (ЧКК), бели krvни клетки (БКК) и тромбоцити. Това може в крайна сметка да доведе до ниски ЧКК (анемия), ниски БКК (леукопения) и повишен риск от синици или krvoproлитане поради ниски тромбоцити, които са есенциални за формиране на корка.
Хепатотоксичност
Остра и хронична хепатотоксичност се докладва най-често поради големи дози или дългосрочно излагане на метotreксat. Хроничната токсичност може да бъде фатална и трябва да бъде внимателно мониторирана. Рискът от токсичност се увеличава от алкохолно използване, диабет, ожирение и стара възраст. Чернодробни щети могат да се получат поради намалени клеточни реакции (напр. метилация) от черния дроб и подтиснато пролиферация.
Имунна и Плъхна система
Метotreксat трябва да се използва с екстремна предпазливост, когато е присъства активна инфекция. То може да причини имунизацията да бъде неефективна. Потенциално фатални опортунистични инфекции (напр. пневмонии) могат също да се случат поради подтиснато активиране и производството на бели krvни клетки.
Неврологични
Нервна щета (невротоксичност) е докладвана при пациенти, лекувани с вътревенозен метotreксat. Странични ефекти са докладвани като лейкоенцефалопатия, което е бяла материя (лейко-) мозък (-енцефало) щета (-патия) и се проявяват като определен вид судороги. Мозъкът и спиналната течност имат високи нива на фолат, което функционира в поддържането на невротрансмитерно производство и ремонт на аминокиселини. Нарушенията на тези процеси са индикирани в производството на судороги и невртотоксичност.
Бобрени (Ренални)
Метotreксat може да индуцира бобренна щета и бобренна недостатъчност. Бобренната токсичност е поради голямата концентрация на метotreксat, която естествено се филтрира от кръвта. Тези високи концентрации могат да доведат до кристално формиране вътре в бобрените, причинвайки щета или недостатъчност.
Кожа
Тежки и понякога фатални кожни реакции са докладвани с метotreксat. Топикални реакции включват свирпене, промени в пигментация, блъстици, срипи и язве. Тежки реакции включват клеточна смърт на тъканите и синдром на Стивънс-Джонсън. Тези състояния могат да се получат поради нарушение на имунната система, водещи до инфекции, и нарушение на тъканев ремонт и репликация при инжекционни или раневи места.