1. Хищни птици
Пеликаните са големи птици, често видяни в стада, и могат да бъдат жертва на хищни птици – орли, ястреби, соколи. Тези хищници често насочват млади или наранени/боледни пеликани.
2. Аллигатори и крокодили
Големи пресмякащи се са опасени хищници. Пеликаните често посещават води, където живяят те, и те могат да засадят и убият пеликани.
3. Други животни
Еноти, лисици, койоти – често насочват гнезда и яйца, могат да убият и възрастни пеликани.
4. Хора
Хората също са заплаха – пеликаните се ловят за перки, месо, яйца. В някои райони се убиват защото се считат за безразлични или заплаха за рибните популации.
5. Разрушаване на обитание
Унищожаването на влажни зони и води за гнездоване/хранене/почиване налага преместване – опасно и води до конфликти с други животни.