Сред плячката на птиците, които представляват заплаха за плешивите орли, са златни орли, големи рогати сови, северни гошави и ястреби с червена опашка. Тези хищници могат да атакуват и убият плешиви орли за храна или за защита на собствените си територии.
По отношение на големите месоядни бозайници, плешивите орли могат да срещнат заплахи от мечки, вълци, койоти и планински лъвове. Тези хищници могат да се насочат към плешиви яйца, пилета или дори възрастни орли, ако намерят възможност.
Освен това, някои влечуги, като големи змии и алигатори, могат да плячкат върху плешиви яйца на орел и млади пилета, ако гнездата им са уязвими и се намират в близост до водни тела или блатисти райони.
Въпреки това си струва да се отбележи, че дейностите, свързани с човека, включително унищожаване на местообитания, лов и замърсяване, представляват значителни заплахи за плешивите орли и други диви животни. Усилията за опазване и правната защита са от решаващо значение за запазването на плешивото население на орел и смекчаване на тези заплахи, предизвикани от човека.