- Лов и стрелба :През 18 и 19 век плешивите орли често се разглеждаха като заплаха за добитъка и селското стопанство и рутинно бяха застреляни и убивани.
- Употреба на пестициди :Широкото използване на пестицида DDT оказа пагубно въздействие върху плешивите популации на орел. DDT причини яйчните черупки да станат тънки и лесно да се счупят, което води до спад на възпроизвеждането и намаляване на плешивата популация на орел.
- Загуба и унищожаване на местообитанията :Унищожаването и промяната на техните естествени местообитания поради човешки дейности като сеч, урбанизация и селско стопанство също допринесоха за упадъка.
Поради тези фактори популацията на плешивия орел намалява драстично и видът е класифициран като застрашен през 70 -те години.