ДДТ, устойчив органохлорен инсектицид, натрупан в тъканите на скален орел и други хищни птици чрез хранителната верига. Тъй като птиците поглъщат замърсена плячка, ДДТ се концентрира в телата им, което в крайна сметка засяга репродуктивния им успех. Едно от най-значимите въздействия на ДДТ върху белоглавите орли е изтъняването на черупките на яйцата. Това се случи, защото ДДТ пречи на метаболизма на калция, ключов минерал за образуването на яйчена черупка. В резултат черупките станаха по-тънки и по-податливи на счупване по време на инкубация, което доведе до намален успех при излюпване и намаляване на популацията.
Намалена имунна функция: ДДТ повлиява и имунната система на плешивите орли, което ги прави по-податливи на болести и инфекции. Това допълнително допринесе за намаляването на популациите им.
Нарушаване на хормоналната регулация: ДДТ може да имитира ефектите на естрогена, женски полов хормон. Това може да наруши нормалния хормонален баланс както при мъжките, така и при женските плешиви орли, което води до репродуктивни проблеми, необичайно развитие и промени в поведението.
Натрупването на ДДТ при възрастни белоглави орли има далечни последици не само за репродуктивния успех и оцеляването на вида, но и за цялата екосистема. Забраната на ДДТ и последващото намаляване на употребата му в много страни изигра критична роля за възстановяването на популациите на белоглав орел.